| 工程系統與科學系 | 2006 | 2007 | 2008 | 2009 |
| 研究計畫數量 | 75 | 58 | 60 | 64 |
| 外來計畫的研究經費總額 (NT$) | 135,825,962 | 77,313,400 | 77,920,100 | 90,170,220 |
| 生醫工程與環境科學系 | 2006 | 2007 | 2008 | 2009 |
| 研究計畫數量 | 36 | 33 | 30 | 30 |
| 外來計畫的研究經費總額 (NT$) | 53,543,848 | 41,067,869 | 58,346,450 | 40,123,000 |
| 核子工程與科學研究所 | -- | -- | 2008 | 2009 |
| 研究計畫數量 | -- | -- | 11 | 22 |
| 外來計畫的研究經費總額 (NT$) | -- | -- | 15,991,932 | 15,650,915 |